民國89年7月關渡創院，胃腸科即已同時創設；胃腸科門診與胃腸科檢查室皆位於三樓，提供胃鏡,大腸鏡與腹部超音波檢查. 民國99年起配合健保局B型肝炎及C型肝炎防治計畫,提供B型肝炎與C型肝炎干擾素及口服抗病毒藥治療.為提供民眾舒適的胃鏡大腸鏡檢查,民國104年起,與台北榮總麻醉科合作,提供無痛胃鏡大腸鏡檢查。

胃腸科專科醫師、內視鏡技術員、超音波技術員。

1.高階超音波掃描機。
2.高階內視鏡系統。
3.標準化內視鏡消毒系統。
4.每日內視鏡鏡些毒作業監測與保養。
5.無痛胃鏡大腸鏡檢查。
6.各種肝炎 (B型肝炎 C型肝炎 脂肪肝等) 諮詢篩檢與治療。
7.各種消化道疾病,肝膽疾病, 胰臟疾病的諮詢篩檢與治療。

胃腸科門診：上午：週一至週六；下午：週一至週五；夜診：週一 、週三。
超音波檢查：週一至週六上午(預約) (下午及夜間超音波檢查 ，須配由主治醫師安排)。
胃鏡檢查：上午：週一至週六；下午：週一至週五；夜診：週一 、週三。
大腸鏡檢查：請配合各主治醫師檢查時間。
無痛胃鏡大腸鏡：由門診醫師評估後，方可預約繳費登記。